Οι αλλαγές στην αυτοδιοίκηση Α΄ Βαθμού του Νομού Κερκύρας περιελάμβαναν και την ενοποίηση των κοινοτήτων Ερεικούσας, Οθωνών και Μαθρακίου, ήτοι των Διαπόντιων νήσων, στο νέο Δήμο Κέρκυρας. Η απορρόφηση των εν λόγω κοινοτήτων από τον ενιαίο Δήμο Κέρκυρας, πέραν των αναπόφευκτων δυσμενών κοινωνικών και οικονομικών συνεπειών, έχει εγείρει ζήτημα ίσης μεταχείρισης σε σχέση με τα προβλεπόμενα για τα υπόλοιπα νησιά γεωγραφικής ιδιομορφίας και πληθυσμιακού και οικονομικού μεγέθους ανάλογου των Διαποντίων.
Επιπλέον, οι Παξοί, καίτοι μέχρι σήμερα αποτελούσαν ιδιαίτερη επαρχία του Ν. Κερκύρας, δεν αναγνωρίστηκαν ως Περιφερειακή Ενότητα, σε αντίθεση με άλλα νησιά ή μικρά νησιωτικά συμπλέγματα του Ιονίου και του Αιγαίου πελάγους προς τα οποία έχουν ανάλογα πληθυσμιακά, γεωγραφικά κλπ. χαρακτηριστικά, γεγονός που στερεί από τη δυνατότητα αυτοτελούς εκπροσώπησής τους στο οικείο Περιφερειακό Συμβούλιο.